Apprêtement de l'antigène

Les protéines endogènes sont dégradées en fragments qui sont ensuite transportés dans le réticulum endoplasmique granuleux où ils se combinent au CMH-I avant d'être acheminés vers l'appareil de Golgi puis la membrane plasmique. Ils pourront alors être reconnus par des lymphocytes T qui vont détruire la cellule

Les cellules phagocytaires comme les macrophages ingèrent des particules exogènes par endocytose. Les particules sont ensuite fractionnées en fragments au sein de vésicules (les phagolysosomes obtenus par fusion de la vésicule d'endocytose avec des lysosomes). Ces vésicules fusionnent ensuite avec des vésicules contenant des molécules de CMH-II avec lesquelles les fragments vont s'associer. Le complexe formé est ensuite exposé à la surface de la membrane plasmique où il va pouvoir stimuler d'autres cellules du système immunitaires (lymphocytes T CD4+) afin qu'elles répondent à cet antigène.