Un fragment nucléotidique A est digéré par une enzyme de restriction : Hind III. La taille des produits de la digestion et du fragment A intact est déterminée par électrophorèse.

Pour cela, on prépare un gel d'agarose à 0,8% en tampon TBE 1X en présence de Gelgreen 10 000X

Un volume de 15 µL de la digestion et de la séquence A non digérée est mélangé à un tampon de charge 6X et les échantillons sont déposés dans les puits du gel.

La migration s'effectue pendant 1h15 à 80 V.

La procédure d'électrophorèse est indiquée ici :