On va réaliser la double digestion des 2 plasmides pGEM-luc (2,5 µg) et pGEX-4T-1 (1µg) avec BamHI et XhoI.
Quantité d'enzyme de restriction
Au laboratoire, la règle est d'utiliser 2 à 3U d'enzyme de restriction par µg d'ADN
Digestion de pGEX-4T-1
Combien d'unités d'enzymes seront-elles nécessaires pour digérer pGEX-4T-1 ?
Digestion de pGEM-luc
Combien d'unités d'enzymes seront-elles nécessaires pour digérer pGEM-luc ?
Volume d'enzymes de restriction
On utilise des enzymes de restriction à la concentration de 3U.µL-1.
Volume de chaque enzyme pour digérer pGEX-4T-1
De quel volume de chaque enzyme de restriction aura-t-on besoin pour digérer pGEX-4T-1 avec 3U d'enzyme ?
Volume de chaque enzyme pour digérer pGEM-luc
De quel volume de chaque enzyme de restriction aura-t-on besoin pour digérer pGEM-luc avec 6U d'enzyme ?
Volume total d'enzyme
On réalise les deux digestions en même temps. On ajoute donc les 2 enzymes, BamHI et XhoI dans le mélange réactionnel.
Volume total d'enzyme pour digérer pGEX-4T-1
Quel sera le volume total d'enzyme dans le mélange réactionnel pour digérer pGEX-4T-1 ?
Volume total d'enzyme pour digérer pGEM-luc1
Quel sera le volume total d'enzyme dans le mélange réactionnel pour digérer pGEM-luc ?
Volume de mélange réactionnel
On peut observer une activité star lorsque la concentration en glycérol dans le mélange réactionnel dépasse 5% (v/v).
Les enzymes de restriction sont conservées dans du glycérol 50% (v/v)
Volume maximum d'enzyme dans le mélange réactionnel
Quel est le volume maximum que les enzymes de restriction peuvent occuper dans le mélange réactionnel pour éviter l'activité star ?
Volume final pour la digestion de pGEX-4T-1
En tenant compte de tous les paramètres précédents, quel devra être le volume minimum du milieu réactionnel pour la double digestion du plasmide pGEX-4T-1 ?
Volume final pour la digestion de pGEM-luc
En tenant compte de tous les paramètres précédents, quel devra être le volume minimum du milieu réactionnel pour la double digestion du plasmide pGEM-luc ?
Tableau de mélange
Compte-tenu de toutes les informations précédentes, compléter le tableau de composition du mélange réactionnel pour la double digestion des plasmides pGEX-4T-1 et pGEM-luc.